Les Yakuza représentent la mafia japonaise. Ils se divisent en nombreux clans plus ou moins influents dans le Japon, et sont souvent difficiles à traquer par la police car rusés et discrets -enfin, tout dépend des clans. Sur TR, deux clans de Yakuza sont représentés, éternels rivaux, que voici.

Il est dirigé par Matsumoto Tôru. C'est un clan relativement récent, qui succède à l'ancien clan de Matsumoto qu'il a lui-même décimé suite à des actes de barbarie ignobles envers sa soeur cadette, Kana. Le mot d'ordre chez les Inagawa-kai est : le respect des règles, et qu'aucun corps ne soit souillé.
Matsumoto a décidé de s'installer à Shinkyo pour plusieurs raisons : élargir son clan, offrir une nouvelle vie à Kana, et profiter de son statut privilégié grâce à son informateur Reborn pour s'emparer du quartier et de ses différents réseaux, clean ou non.

Il est dirigé par Hiroyuki Yuichi. Clan beaucoup plus ancien que Inagawa-kai, le fils a repris les rênes du clan en succédant à son père, et pour prouver sa force, a abattu de sang-froid le bras-droit de son défunt géniteur. Il a gagné le respect du clan et en a pris sa tête. Les Yamaguchi-gumi sont beaucoup moins pacifistes que les Inagawa-kai et font beaucoup dans la violence et la torture.
Si Hiroyuki a décidé d'installer son clan à Shinkyo, c'est uniquement parce qu'il n'abandonnera jamais son désir de surpasser Matsumoto, son rival de toujours. Il a donc conquis la seconde moitié de Shinkyo que Inagawa-kai ne possédait pas encore.

Si vous décidez d'interpréter un Yakuza sur TR, il vous faudra appartenir à un des clans (si vous voulez appartenir à un autre clan, merci de MPer Matsumoto Tôru). Voici les rôles disponibles :

★ Clan Yamaguchi-gumi
- Oyabun (chef de clan) HIROYUKI Yuichi, scénario
- Wakagashira (bras-droit) SAKAI Akito, scénario
- Shateigashira (second lieutenant) 0/1
- Saiki-komon (administrateur) 0/1
- Shingiin (conseiller juridique) 0/1
- Kaikei (Comptables) 0/5 (un par domaine)
- Kyodai (grands frères) 0/...
- Shatei (petits frères) 0/...

★ Clan Inagawa-kai
- Oyabun MATSUMOTO Tôru
- Wakagashira (bras-droit) 0/1
- Shateigashira (second lieutenant) MITSUJI Masaru, scénario
- Saiki-komon (administrateur)
- Shingiin (conseiller juridique) 0/1
- Kaikei (Comptables) 0/5 (un par domaine)
- Kyodai (grands frères) 0/...
- Shatei (petits frères) 0/...